淀粉样蛋白A（SAA）与CRP相仿，用以评估急性相反应进程。SAA是个灵敏的参数，它在炎性反应大约8h后开始升高，且超过参考范围上限时间早于CRP，然而CRP在正常人中的中位数值与参考范围上限的差距，大约有10倍。在SAA中仅有5倍。轻微感染，例如，许多病毒感染，SAA升高要比CRP更为常见。在感染性疾病中，SAA的绝对上升要高于CRP，因此SAA测定，尤其对“正常”与微小急性相反应可提供更好的鉴别。通常约2/3感冒患者SAA升高，但少于1/2的患者相同表现CRP升高。在病毒感染病例中，SAA和CRP浓度升高见于腺病毒感染者。

SAA和CRP的反应形式在急性感染的恢复阶段是平行的，这同时适用于细菌和病毒感染。

红斑狼疮和溃疡性结肠炎SAA并不升高。

恶性肿瘤转移阶段SAA升高通常比肿瘤局限于器官阶段显示较高的数值。

对于移植排异，SAA检测是一个相当灵敏的指标。在对一项肾移植受者的研究中，97%的发生排异的检查是依据SAA的升高。在不可逆转的移植排异检测中，其平均浓度达690±29mg/L，而可逆排异发作病例的相关水平为271±31mg/L。

类风湿性关节炎、结核病或麻风病患者SAA浓度的慢性升高，是合成AA-淀粉纤维的先决条件，这也被用来诊断继发性淀粉样变性病变。

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